马晓年,出生于1945年,1969年毕业于北京医科大学医学系。1981年毕业于中国协和医科大学。获医学硕士学位。1982-1983年在英国进修。回国后曾在国家计划生育委员会科学技术研究所从事男性学和性医学方面的研究工作,任副研究员。
马晓年还担任中华医学会男科学分会委员兼秘书,北京性健康教育研究会副会长,自1993年起获美国性学委员会性治疗学家资格证书。曾参与主持七五攻关项目“准弹性激光光散射精子测量仪的研制”,评为国家级科技成果并获1990年全国发明展览会金牌奖;完成部委级科研项目“精子运动特性自动检测系统的临床应用”;完成性教育电脑咨询专家系统(计算机软件)的开发并由国家计生委向全系统推荐。